Binnen de sector Bestuur van HEC vallen de ministeries van Binnenlandse, Buitenlands en Algemene Zaken, daarnaast ook de Hoge Colleges van Staat (bv. Parlement en Raad van State) en de gemeenten, provincies en waterschappen.

Bij alle organisaties spelen vraagstukken rond bedrijfsvoering waarbij het streven is kwaliteitsverbetering en een hogere efficiency hand in hand te laten gaan.

Bij de kerndepartementen zijn momenteel vooral de consequenties van de voorstellen van de commissie Bekker aan de orde. Er is een aanzienlijke bezuinigingstaakstelling maar ook de wens om de rijksoverheid doelmatiger te laten functioneren door een scheiding van beleid en ondersteuning en door concentratie van beide onderdelen. De inzet van ICT zal in dit proces van groot belang zijn en ook de concentratie van de ICT zelf binnen Shred Services is nadrukkelijk aan de orde. Hierbij horen natuurlijk ook sturingsconcepten die de individuele departementen overstijgen.

Bij gemeenten, provincies en waterschappen zijn ook de primaire processen in het geding. De rode draad is daar de invoering van de bouwstenen van de E-overheid zoals deze door de ICTU worden ontwikkeld en door de GBO beheerd. Daarnaast zoeken de mede-overheden ook naar eigen manieren om hun dienstverlening te verbeteren.

HEC is in verschillende rollen actief betrokken bij al deze ontwikkelingen. Daarnaast is de ICTU een zeer belangrijke opdrachtgever van HEC. Vele HEC medewerkers functioneren als programmamanager/kwartiermaker, adviseur of projectleider binnen ICTU programma's en dragen zo actief bij aan de ontwikkeling van de E-overheid. HEC draagt ook bij aan de implementatie daarvan door de ontwikkeling van het concept van de I-teams die overheden ondersteunen bij de implementatie.

Van groeiend belang binnen de sector is de algemene kaderstelling in de vorm van de ontwikkeling van een landelijke architectuur (de NORA) en van landelijke standaarden.